Οι μυκοτοξίνες βρίσκονται στο 25% της παγκόσμιας παραγωγής καρπών. Προκαλούν μεγάλες οικονομικές απώλειες στη ζωική παραγωγή όπως επίσης μερικές μυτοτοξίνες είναι καρκινογόνες και τερατογόνες στον άνθρωπο καθώς μεταφέρονται από το γάλα ή το κρέας.
Τα κλινικά συμπτώματα εξαρτώνται από τη δόση και το χρόνο. Όταν οι ζωοτροφές είναι μολυσμένες περισσότερο από μία μυτοτοξίνη, τα τοξικολογικά αποτελέσματα είναι αθροιστικά και μερικές φορές συνεργικά. Τα κλινικά συμπτώματα γνωστών μυκοτοξινών είναι συνήθως υποκλινικά ή χρόνια αλλά με σημαντικές αρνητικές επιπτώσεις στην παραγωγικότητα.
Ο παρακάτω πίνακας καταγράφει τα συμπτώματα που μπορεί να παρατηρηθούν σε χοιροτροφικές μονάδες:
| Μυκοτοξίνες | Επιπτώσεις | Κλινικά συμπτώματα | Ευαισθησία του χοίρου |
| Aflatoxins | Ανοσοκαταστολή. Μείωση κατανάλωση τροφής |
Αυξημένη ευαισθησία στα νοσήματα. Κακός ρυθμός ανάπτυξης. Αποβολή-αγαλαξία. |
Υψηλή |
| Zearalenone | Μιμητικές των οιστρογόνων. | Ανοιστρος. Ψευδοκύηση. Διόγκωση του αιδοίου και του μαστού. Αποβολή. Μειωμένη γονημότητα. Αυξηση μη παραγωγικών ημερών. Μείωση της τοκετομάδας και της ζωτικότητας των χοιριδίων. Μείωση της γεννητίσιας ορμής, της παραγωγής σπέρματος, της ζωής του σπέρματος και του μεγέθους των όρχεων. |
Υψηλή |
| Trichothecenes | Ερεθισμός δέρματος και στοματικής κοιλότητας. Ανοσοκαταστολή. |
Μείωση στην κατανάλωση τροφής. Εμετός, Πεπτικά προβλήματα. Αυξημένος ΔΜ. |
Υψηλή |
| Ochratoxin A | Αλλοιώσεις στη ρινική κοιλότητα. Ανοσοκαταστολή. |
Μείωση ρυθμού ανάπτυξης. Πολυδιψία. |
Μέτρια |
| Ergot | Μείωση κατανάλωση τροφής. | Μείωση ρυθμού ανάπτυξης. Μείωση βάρους γεννηθέντων χοιριδίων. Αγαλαξία. |
Μέτρια |
| Fumonisin | Μείωση αριθμού και σύνθεση ερυθρών αιμοσφαιρίων. | Πνευμονικό οίδημα. Αναπνευστική ανεπάρκεια. Μείωση στην κατανάλωση τροφής. |
Υψηλή |
Η υψηλή θερμοκρασία και οι υψηλές πιέσεις κατά τη διάρκεια του στεγνώματος και κατεργασίας των καρπών μπορεί να μειώσει το φορτίο σε μύκητες αλλά οι μυτοτοξίνες είναι ανθεκτικές στις θερμοκρασίες που σκοτώνουν τους μύκητες και να παραμείνουν στις ζωοτροφές χωρίς την παρουσία μυκήτων. Οι περισσότερες μυκοτοξίνες είναι χημικά σταθερές και παραμένουν για καιρό μετά τον θάνατο των μυκήτων
Κάποιες περιοχές έχουν μεγαλύτερο κίνδυνο για μερικές μυτοτοξίνες λόγο των τοπικών συνθηκών όπως ζεστές και υγρές συνθήκες πάχνη ρεύματα και καταστροφές από έντομα.